Los investigadores desarrollaron una puntuación de riesgo poligénico para la enfermedad renal crónica (ERC) que funcionó bien en poblaciones ancestralmente diversas.
La puntuación de riesgo combina el riesgo de las variantes del gen APOL1, que confieren un alto riesgo de ERC entre las personas negras, así como pequeños riesgos de miles de otras variantes genéticas.
Los efectos APO1 y poligénicos fueron aditivos.
La puntuación se probó en 15 grandes cohortes de personas de ascendencia africana, asiática, europea y latina.
En cada uno de los ancestros, las personas con puntajes de riesgo en el 2% superior tenían un riesgo tres veces mayor de ERC en comparación con las personas con puntajes de riesgo más bajos, lo que es similar al mayor riesgo de ERC por tener antecedentes familiares de enfermedad renal.
El estudio realizado por Atlas Khan, PhD, instructor en ciencias médicas, y el autor principal Krzysztof Kiryluk, MD, profesor asistente de la División de Nefrología, Departamento de Medicina, Universidad de Columbia, Nueva York, y colegas, se publicó recientemente en Medicina natural.
A pesar de ciertas limitaciones, “nuestro estudio demuestra que [a clinically] la predicción poligénica significativa de la ERC está al alcance”, resumen Khan y Kiryluk en un informe de investigación, también publicado en Medicina natural.
“Se necesitan refinamientos adicionales de la puntuación de riesgo, pero solo deberían mejorar su desempeño actual”, agregan.
“Las variantes heredadas en APOL1 (un gen bien establecido para la enfermedad renal con gran efecto en personas de ascendencia africana) también se tienen en cuenta en la ecuación de puntuación de riesgo que incluye miles de otras variantes con efectos menores que se descubrieron en GWAS [genome-wide association studies]”, explicó Kiryluk a Noticias médicas de Medscape en un correo electrónico.
Los pacientes proporcionarían una muestra de sangre o saliva para la prueba de ADN, a partir de la cual se determinaría una puntuación de riesgo de ERC, anotó.
Por ahora, esto solo se está haciendo en un entorno de investigación.
La investigación se realizó como parte del estudio Electronic Medical Records and Genomics-IV (eMERGE-IV), un estudio nacional financiado por los Institutos Nacionales de la Salud que comenzó a reclutar a 20 000 participantes para evaluar de forma prospectiva las puntuaciones de riesgo de 10 enfermedades comunes.
Las “preguntas clave”, dijo Kiryluk, “son (1) si las pruebas genéticas ayudan a detectar la enfermedad renal temprana que de otro modo no se detectaría, y (2) si la prueba positiva desencadena la adopción de modificaciones protectoras en el estilo de vida por parte de los pacientes que pueden ayudar para prevenir el desarrollo de la enfermedad renal”.
La puntuación de riesgo también podría ayudar potencialmente con la selección de donantes de riñón.
Creación de una puntuación de riesgo poligénico clínicamente significativa para la ERC
“Nuestro estudio tuvo como objetivo probar si el conocimiento existente sobre APOL1 y las contribuciones poligénicas a la función renal es suficiente para construir una puntuación de riesgo poligénico clínicamente significativa para la ERC con un rendimiento reproducible en poblaciones ancestralmente diversas”, escriben Khan y Kiryluk.
Combinaron los genotipos de riesgo de APOL1 con GWAS para la función renal y diseñaron, optimizaron y validaron una puntuación poligénica de todo el genoma para la ERC.
Luego probaron la puntuación en 15 cohortes independientes, incluidas tres cohortes de ascendencia europea (con un total de 97 050 personas), seis cohortes de ascendencia africana (14 544 personas), cuatro cohortes de ascendencia asiática (8625 personas) y dos cohortes mixtas de latinos. (3625 personas).
La cohorte prospectiva eMERGE-IV proporcionará evidencia de si la detección genética de la ERC es clínicamente efectiva.
“Estudio importante”, “Se necesita hacer más trabajo”
“Este es un estudio importante”, dijo Madhav C. Menon, MBBS, MD, profesor asociado y nefrología y director de investigación en trasplante de riñón, Escuela de Medicina de Yale, quien no participó en esta investigación. Noticias médicas de Medscape en un correo electrónico.
Utiliza tamaños de muestra robustos, señaló, con múltiples ascendencias representativas para desarrollar una puntuación de riesgo cuantitativa y continua utilizando varias variantes genéticas en todo el genoma.
Un hallazgo clave es que confirma el riesgo único de enfermedad renal en personas de ascendencia africana que tienen dos copias de variantes en el gen APOL1 (G1 y G2).
“Creo que esto podría ser útil para que los médicos conozcan la probabilidad de riesgo de ERC para aconsejar a sus pacientes”, dijo Menon.
“Sin embargo, como admiten los autores”, continuó, “dado que sus datos no captaron bien los antecedentes familiares de enfermedad renal de los registros médicos, no se sabe a partir de esto si la puntuación será una mejora sobre este conocimiento para predecir el riesgo de ERC”. trabajar.”
Los investigadores sí señalan, anotó, “que en otras enfermedades, como la diabetes, las puntuaciones de riesgo poligénico son mejores que los antecedentes familiares.
“Creo que en los próximos años, la información genética podría convertirse en una parte integral de todos los registros médicos”, especuló Menon.
Esta información podría usarse en escenarios de trasplante. Sin embargo, en esta etapa, “tal extrapolación aún es prematura”, advirtió.
Habría que superar los problemas logísticos, éticos y de seguros.
“La principal desventaja”, según Menon, “es que el [CKD risk] La partitura es un poco como una caja negra”.
Los autores conocen los loci genéticos exactos, que probablemente sean numerosos, que están involucrados en la composición de la partitura, continuó, pero aún no se comprende el peso de las contribuciones individuales. También se desconocen los mecanismos que operan cuando un puntaje conduce a una ERC.
“Lo más importante”, dijo Menon, es que no se sabe qué debe hacer específicamente un médico cuando se ha identificado un portador de puntuación de riesgo en el 2% superior.
“Por lo tanto, mientras [this is] un avance importante, aún queda mucho trabajo por hacer”.
Los autores y Menon han declarado no tener ningún conflicto de interés económico pertinente.
Nat Med. Publicado en línea el 16 y el 23 de junio de 2022. Resumen, Informe de investigación
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