Crédito: Revista de la Sociedad Americana de Espectrometría de Masas (2024). DOI: 10.1021/jasms.4c00146
Las estrategias de control de calidad (QC) para monitorear y evaluar el rendimiento del instrumento durante el análisis de espectrometría de masas son cruciales para garantizar que los datos generados sean de alta calidad, reproducibles y precisos.
En particular, en el caso de la metabolómica y la lipidómica, los enfoques de control de calidad tradicionales a menudo implican la inspección manual de los datos, lo que requiere mucho tiempo, es subjetivo, propenso a errores humanos y no es viable para estudios de alto rendimiento con cientos de muestras.
Un equipo de científicos del Laboratorio Nacional del Pacífico Noroeste (PNNL) y el Laboratorio de Ciencias Moleculares Ambientales (EMSL) han desarrollado PeakQC, una nueva herramienta de software para el control de calidad automatizado de datos de espectrometría de masas.
Los hallazgos son: publicado en el Revista de la Sociedad Americana de Espectrometría de Masas.
A diferencia de las herramientas de control de calidad existentes que se centran en tipos específicos de moléculas, PeakQC puede analizar datos de varios campos “ómicos”, como la proteómica, la metabolómica y la lipidómica. El software realiza evaluaciones de control de calidad globales y detalladas y funciona con diferentes instrumentos y configuraciones experimentales, incluida la cromatografía líquida y la espectrometría de movilidad iónica.
Al proporcionar un control de calidad automatizado que funciona con distintos tipos de moléculas y configuraciones experimentales, este nuevo software puede ayudar a los investigadores a mantener la fiabilidad de los datos y detectar problemas de forma temprana. Esto podría conducir a un uso más eficiente de los recursos, una mejor reproducibilidad en los experimentos y, en última instancia, a conclusiones científicas más fiables.
La flexibilidad de la herramienta la hace especialmente valiosa a medida que más estudios combinan múltiples enfoques “ómicos”. PeakQC permite la recopilación de datos de alta calidad en proyectos de usuarios a gran escala en EMSL y dentro de PNNL. La herramienta no solo permite la comparación de resultados de múltiples enfoques de espectrometría de masas, sino que también facilita la recopilación de datos reproducibles.
El programa de software utiliza algoritmos avanzados y aprendizaje automático para analizar datos de varios tipos de instrumentos y métodos experimentales, incluidos modos de adquisición dependientes e independientes de los datos.
El software es una herramienta de escritorio e independiente que genera gráficos y métricas de diagnóstico sin depender de otras herramientas de identificación molecular, que suelen ser complicadas de configurar y usar. Está disponible de forma gratuita, es fácil de usar y no requiere instalación. Una vez descargada, los usuarios pueden ejecutar la herramienta en su propio dispositivo.
PeakQC puede utilizar iones especificados por el usuario o iones detectados automáticamente para extraer métricas de control de calidad. Este enfoque le permite identificar causas específicas de problemas de rendimiento, a diferencia de algunas herramientas existentes que solo brindan evaluaciones de calidad generales.
Al ofrecer un enfoque unificado para el control de calidad en diferentes campos “ómicos”, PeakQC representa un avance significativo en el análisis de datos de espectrometría de masas. Su desarrollo resalta la creciente importancia de un control de calidad sólido y automatizado en estudios científicos a gran escala que utilizan espectrometría de masas.
Más información:
Andrea Harrison et al, PeakQC: una herramienta de software para el control de calidad automatizado y agnóstico de datos de espectrometría de masas, Revista de la Sociedad Americana de Espectrometría de Masas (2024). Documento de la investigación: 10.1021/jasms.4c00146
Proporcionado por el Laboratorio de Ciencias Moleculares Ambientales
Citación:Una nueva herramienta de software permite el control de calidad independientemente de los tipos moleculares ómicos y se puede utilizar en múltiples plataformas (4 de septiembre de 2024) recuperado el 4 de septiembre de 2024 de
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