En aumento: el personal médico ayuda a los pacientes en una clínica que trata a pacientes con COVID-19, en China. | Crédito de la foto: Getty Images
La historia hasta ahora: Desde el brote inicial en 2019 en Wuhan, China, el mundo ha visto múltiples oleadas repetidas de infecciones por COVID-19 en los últimos años, impulsadas en gran medida por las variantes emergentes de preocupación (COV) del virus causante, el SARS-CoV-2. . Sin embargo, hasta hace poco, China logró contener la propagación de la enfermedad gracias a su celosa política de “cero-COVID”, que incluía cuarentenas masivas, cierres y programas de vacunación temprana. Como resultado del levantamiento abrupto de la política, el país ahora enfrenta un aumento de casos de COVID-19.
¿Cuáles son los linajes del SARS-CoV-2 que circulan en China?
En el transcurso de la pandemia, la secuenciación del genoma del virus y el intercambio rápido de datos ha sido clave para rastrear la evolución del SARS-CoV-2 y la identificación temprana de variantes emergentes. Los datos de secuenciación del SARS-CoV-2 enviados previamente desde China a GISAID, un repositorio accesible a nivel mundial de secuencias del genoma del SARS-CoV-2, muestran que a lo largo de los meses, el país ha visto casos aislados vinculados a múltiples variantes del virus vistas anteriormente. Estos incluyen Delta y sus sublinajes en 2021 y Omicron y sus sublinajes en 2022. Solo 30 secuencias de SARS-CoV-2 recopiladas entre octubre y diciembre de 2022 están disponibles en GISAID de China. Estos pertenecen a 14 linajes diferentes de SARS-CoV-2, todos los cuales son sublinajes de Omicron, incluidos BA.5.2, BQ.1.1, BF.7, BF.5, BA.2.75 y el linaje recombinante XBB.
De los 14 genomas de China disponibles en GISAID para el mes de diciembre, dos genomas pertenecen a los sublinajes BF.7, BF.5 y BA.2.75 de Omicron, mientras que un genoma pertenece al linaje recombinante XBB. Los linajes BF5 y BF.7 de SARS-CoV-2, aunque se detectaron por primera vez en enero de 2022 en Francia, también se detectaron previamente en India en mayo y julio de 2022, respectivamente, mientras que el linaje BA.2.75 se detectó por primera vez en India tan pronto como Diciembre de 2021. El linaje recombinante XBB también se detectó previamente a principios de 2021 en varios países de Asia, incluidos India y Singapur. Con el número limitado de genomas disponibles correspondientes al brote en curso, todavía no sabemos qué variantes están impulsando la ola en China.
¿Qué sublinajes de Omicron están bajo supervisión?
Debido a la difusión a gran escala de Omicron y sus sublinajes en todo el mundo, la Organización Mundial de la Salud (OMS) ha agregado otra categoría de variantes denominadas “subvariantes de Omicron bajo control”.
Actualmente, las subvariantes de Omicron que se monitorean en esta categoría incluyen BA.2.75, BA.4.6, XBB, BA.2.3.20 y sublinajes de BA.5, incluidos BF.7 y BQ.1. Si bien la primera muestra perteneciente al linaje BA.4.6 data de diciembre de 2021, el linaje BA.2.3.20 se detectó en varios países recientemente en agosto de 2022.
¿Qué es el linaje XBB?
El virus SARS-CoV-2 tiene el potencial de evolucionar mediante el intercambio de grandes fragmentos del genoma, lo que se denomina recombinación. Detectado por primera vez en enero de 2022, el linaje XBB de SARS-CoV-2 resultó de la recombinación entre los sublinajes BA.2.10.1 y BA.2.75 de Omicron. El linaje se detectó en gran medida en genomas de Singapur e India, con la mayor cantidad de genomas en GISAID pertenecientes a EE. UU. e India. Aunque se detectó en más de 30 países, no se ha observado una asociación del linaje con un aumento sostenido de nuevos casos en la India, pero ahora se ha convertido en la variante dominante en muchos países que registran un aumento en las infecciones. Por lo tanto, monitorear la prevalencia de XBB y sus sublinajes será esencial en los próximos días.
Aunque BA.5 se detectó por primera vez en noviembre de 2021, a lo largo de los meses han surgido ciertos sublinajes BA.5 que tienen mutaciones en sitios antigénicos clave en el virus, incluidos BF.7, BF.14 y BQ.1. El linaje BQ.1 es un sublinaje BA.5 que tiene las mutaciones K444T y N460K en la proteína espiga del virus. Con más del 5% de los casos globales, se ha visto que la variante tiene una ventaja de crecimiento sobre otros linajes en regiones altamente vacunadas, como Europa y los EE. UU., por lo que es importante monitorear la propagación y evolución de este sublinaje.
Con la disminución de la inmunidad a la vacunación y las oleadas anteriores de Omicron que conducen a reinfecciones, la vigilancia genómica será la clave para comprender la evolución continua de Omicron. Al ser inmune a Omicron, un aumento abrumador de casos en un país populoso como China no solo causará pérdidas masivas de vidas, sino que también permitirá que el virus mute con el potencial de crear nuevas variantes. Por lo tanto, se requieren urgentemente esfuerzos de gran alcance para monitorear la situación de COVID-19 en China y otros países, incluida la vigilancia genómica y el uso de métodos probados con evidencia científica significativa.
(Los autores son investigadores del Instituto CSIR de Genómica y Biología Integrativa en Delhi. Todas las opiniones expresadas son personales)