El fragmentado sistema de salud de EE. UU. Está obstaculizando los esfuerzos del país para secuenciar rápidamente los casos de Covid-19 para poder rastrear la variante Delta y posibles mutaciones futuras, advirtieron científicos y compañías de laboratorio.
La secuenciación genómica es un arma vital en el arsenal de los funcionarios de salud pública mientras luchan por controlar variantes como el Delta que se propaga rápidamente, así como la efectividad de las vacunas contra las nuevas cepas.
Sin embargo, la atención médica en los EE. UU., Que se brinda a través de un enorme mosaico de operadores públicos y privados que a menudo tienen dificultades para compartir datos, ha provocado que las capacidades de secuenciación genómica del país se rezaguen con respecto a otras naciones con altas tasas de vacunación.
“El Reino Unido realmente se puso al frente en este espacio desde el principio”, dijo Bronwyn MacInnis, director de vigilancia genómica de patógenos en el Instituto Broad en Massachusetts. “Estados Unidos no hizo eso, no dio prioridad a la secuenciación genómica hasta que realmente surgió la amenaza de las variantes a principios de este año”.
En los últimos 30 días, EE. UU. Ha secuenciado el 2.8 por ciento de sus casos positivos de Covid y ha compartido esa información con GISAID, la principal base de datos genómica mundial que ayuda a realizar un seguimiento de las nuevas variantes.
En comparación, el Reino Unido e Israel, países que tienen tasas de vacunación igualmente altas, han secuenciado los casos y han compartido datos aproximadamente el triple de esa tasa: 9,3% y 8,5%, respectivamente.
También le tomó a Estados Unidos más de dos semanas agregar sus datos a GISAID, frente a nueve días para el Reino Unido y 12 días para Israel.
En el Reino Unido, la atención médica es proporcionada por el Servicio Nacional de Salud de pagador único, mientras que los israelíes tienen el mandato de unirse a uno de los cuatro planes de seguro médico oficiales conocidos como Kupat Holim.
“Sigue siendo un desafío logístico”, dijo Will Lee, vicepresidente de ciencia de la empresa de genómica Helix, que tiene un contrato de secuenciación con los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades de EE. UU., La principal agencia de salud pública. “Con tantos lugares y medios diferentes para hacerse la prueba, puede ser difícil obtener las secuencias”.
“Debido a la naturaleza dispar de cómo se manejan las cosas en los EE. UU., Tanto desde la perspectiva del proveedor de atención médica como desde la perspectiva de la salud pública, el desafío es reunir todos los datos”, agregó Lee.
El CDC dijo que se había asociado con compañías de laboratorios clínicos y laboratorios universitarios para expandir la escala y la velocidad de las capacidades de secuenciación del país.
“A medida que las variantes comenzaron a surgir. . . Los CDC establecieron un enfoque multifacético para la vigilancia genómica para monitorear la evolución de Sars-Cov-2 y detectar variantes que están surgiendo en los Estados Unidos ”, dijo la agencia.
“Con nuestra estrategia de vigilancia actual, los CDC confían en que las variantes nuevas y emergentes se detectarán mucho antes de que se vuelvan prominentes”, agregó.
Pero los científicos dicen que la infraestructura de secuenciación genómica en los EE. UU. Sigue siendo lenta y burocrática, y que el país corre el riesgo de detectar variantes con menos rapidez.
El CDC dijo que actualmente secuencia alrededor del 10 por ciento de los casos positivos identificados en sus propios laboratorios y en los de sus socios, aunque eso representa una fracción de la capacidad de prueba, que es realizada predominantemente por operadores privados y hospitales.
Arthur Reingold, jefe de epidemiología de Berkeley Public Health en California, dijo que la naturaleza dispersa de las pruebas y la secuenciación era la “razón central” por la que Estados Unidos había sido más lento en la secuenciación del virus que el Reino Unido.
“Si tiene un NHS y los laboratorios que lo acompañan. . . puede organizar a las personas y hacer que hagan las cosas de manera coherente mucho más fácilmente que si está tratando de organizar muchos proveedores y laboratorios diferentes ”, dijo. “Es mucho más difícil armar eso”.
MacInnis del Broad Institute dijo: “Ciertamente tuvimos la capacidad de secuenciar y no tuvimos escasez de pruebas positivas durante bastante tiempo durante la pandemia”. La mayor barrera para “cerrar la brecha” con otros países fue la dificultad de obtener pruebas positivas en los sitios de secuenciación, agregó.
Las diferentes reglas de los estados de EE. UU. Sobre el intercambio de datos también están obstaculizando los intentos de construir una imagen coherente de cómo y dónde están surgiendo nuevas variantes. Algunos estados y departamentos de salud no están dispuestos a compartir datos granulares de ubicación o información detallada, como si una persona que da positivo en la prueba ha sido vacunada.
“En cada paso del camino existen regulaciones que buscan proteger la privacidad individual. . . pero [they] también puede prevenir el tipo de intercambio rápido de información que necesitamos ”, dijo Thomas Friedrich, profesor de ciencias patobiológicas en la Universidad de Wisconsin-Madison, que ha estado secuenciando los casos de Covid.
Añadió: “Cada estado y localidad tiene su propia combinación de estas regulaciones y diferentes formas de interpretar las regulaciones federales”.
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