Han surgido nuevas y explosivas afirmaciones de que China eliminó un conjunto de datos que contenía secuencias de covid de principios de la epidemia de Wuhan que podrían proporcionar pistas vitales en la búsqueda del ‘Paciente Cero’ que provocó una pandemia mundial. La investigación científica también sugiere que el virus estaba circulando en Wuhan antes de que se detectara en los mercados húmedos locales.
Sugiere que los primeros virus covid investigados por la Organización Mundial de la Salud no son completamente representativos de las cepas de virus que circulan en esos primeros meses. El virus ha matado ahora a casi cuatro millones de personas.
El profesor Jesse Bloom, profesor asociado del Centro de Investigación del Cáncer Fred Hutch, con sede en Seattle, publicó la nueva investigación el miércoles.
Revela que un conjunto de datos que contiene secuencias de SARS-CoV-2 de principios de la epidemia de Wuhan ha sido eliminado del Archivo de Lectura de Secuencias del Instituto Nacional de Salud.
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El trabajo de investigación, La recuperación de datos de secuenciación profunda eliminados arroja más luz sobre la epidemia temprana de SARS-CoV-2 de Wuhan, había identificado un conjunto de datos que contenía secuencias de SARS-CoV-2 de principios de la epidemia de Wuhan que se eliminó del Archivo de Lectura de Secuencias de los NIH.
“Recupero los archivos eliminados de Google Cloud y reconstruyo secuencias parciales de 13 virus epidémicos tempranos”, escribe el profesor Boom en el resumen del informe.
Y encuentra que no hay una razón plausible para los archivos perdidos que fueron eliminados y la explicación más probable es que China eliminó el material para “ocultar su existencia”.
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“El hecho de que se haya eliminado un conjunto de datos tan informativo tiene implicaciones más allá de las obtenidas directamente de las secuencias recuperadas. Las muestras de pacientes ambulatorios tempranos en Wuhan son una mina de oro para cualquiera que busque comprender la propagación del virus ”, escribe.
“Incluso mi análisis de las secuencias parciales es revelador, y claramente habría sido más científicamente informativo secuenciar completamente las muestras en lugar de eliminar subrepticiamente las secuencias parciales. No hay una razón científica plausible para la eliminación: las secuencias concuerdan perfectamente con las muestras descritas en Wang et al. Por lo tanto, parece probable que las secuencias se hayan eliminado para ocultar su existencia “.
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El virólogo es un actor importante en el debate sobre los orígenes del covid y cofirmó una carta influyente en mayo de científicos que pedían una mayor investigación científica sobre los orígenes del virus.
Su investigación sugiere que las secuencias del mercado de mariscos de Huanan que son el foco del informe conjunto OMS-China no son completamente representativas de los virus en Wuhan al principio de la epidemia.
En cambio, el progenitor de secuencias conocidas de SARS-CoV-2 probablemente contenía tres mutaciones relativas a los virus del mercado que lo hacían más similar a los parientes del coronavirus de murciélago del SARS-CoV-2.
“Comprender la propagación del SARS-CoV-2 en Wuhan es crucial para rastrear los orígenes del virus, incluida la identificación de eventos que llevaron a la infección del paciente cero”, escribe el profesor Bloom.
“Los primeros informes fuera de China a fines de diciembre de 2019 enfatizaron el papel del mercado de mariscos de Huanan (ProMED 2019), que inicialmente se sugirió como un sitio de zoonosis.
“Sin embargo, esta teoría se volvió cada vez más tenue a medida que se supo que muchos de los primeros casos no tenían conexión con el mercado.
“Con el tiempo, el director chino de los CDC, Gao Fu, descartó la teoría y afirmó:“ Al principio, asumimos que el mercado de productos del mar podría tener el virus, pero ahora el mercado es más como una víctima. El nuevo coronavirus había existido mucho antes ”.
El profesor Bloom señala que hubo informes de casos que precedieron con mucho al brote en el mercado de mariscos de Huanan y la respetada revista médica The Lancet describió un caso confirmado sin asociación con el mercado cuyos síntomas comenzaron el 1 de diciembre de 2019.
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El South China Morning Post también describió nueve casos de noviembre de 2019, incluidos detalles sobre la edad y el sexo del paciente, y señaló que ninguno fue confirmado como “paciente cero”.
A pesar de esto, el informe OMS-China descartó todos los casos reportados antes del 8 de diciembre como no COVID-19, y revivió la teoría de que el virus podría haberse originado en el mercado de mariscos de Huanan.
El profesor Bloom recuperó los archivos eliminados de Google Cloud y reconstruyó secuencias parciales de 13 virus epidémicos tempranos.
Pero los datos recuperados también contienen un nuevo misterio. Los datos del virus que recuperó el profesor Bloom no eran los que esperaba el científico.
“Ahora necesito dar antecedentes para explicar un misterio científico confuso sobre otras secuencias tempranas de # SARSCoV2. Aunque los eventos que llevaron a la aparición de # SARSCoV2 en Wuhan no están claros (zoonosis vs accidente de laboratorio), todos están de acuerdo en que los antepasados profundos son los coronavirus de los murciélagos ”, dijo.
“Por lo tanto, esperaríamos que las primeras secuencias de # SARSCoV2 fueran más similares a los coronavirus de murciélago y, a medida que el # SARSCoV2 continuara evolucionando, se volvería más divergente de estos ancestros. ¡Pero ese no es el caso!
“En cambio, los primeros virus # SARSCoV2 de Huanan Seafood Market son más diferentes de los coronavirus de murciélago que los virus # SARSCoV2 recolectados más tarde en China e incluso en otros países”.
El profesor Bloom escribe que hay un par de escenarios que pueden explicar este resultado.
“¿Cómo se relacionan las secuencias eliminadas que recuperé con este acertijo? Si incluimos esas secuencias, y las secuencias de la nota 4 de Guangdong son de dos grupos de personas infectadas en Wuhan a fines de diciembre / principios de enero, obtendremos escenarios plausibles que resuelven los problemas anteriores ”, dijo.
“Estos dos escenarios se trazan a continuación. Cada uno tiene un ‘progenitor’ diferente, que es la secuencia que dio lugar a todas las secuencias # SARSCoV2 * actualmente * conocidas (aún puede no ser el virus que infectó al paciente cero si otras secuencias tempranas permanecen desconocidas).
“Ambos progenitores putativos tienen 3 mutaciones en relación con los virus de Seafood Market que los hacen más similares al coronavirus de murciélago.
“Ambos progenitores sugieren que # SARSCoV2 estaba circulando en Wuhan antes del brote de diciembre en Huanan Seafood Market, lo que está corroborado por muchas otras pruebas, incluidos artículos de noticias de China a principios de 2020.
“El intercambio de secuencias podría verse aún más limitado por el hecho de que los científicos en China están bajo una orden del Consejo de Estado que requiere la aprobación central de todas las publicaciones
“La segunda implicación importante es que puede ser posible obtener información adicional sobre la propagación temprana de # SARSCoV2 en Wuhan incluso si los esfuerzos para realizar más investigaciones sobre el terreno se ven obstaculizados.
“La comunicación científica y el intercambio de datos suelen depender de la confianza. El archivo de lectura de secuencia de los NIH tiene> 13.000.000 de ejecuciones, por lo que deben confiar en los autores cuando solicitan eliminaciones, ya que no son factibles para validar las razones de todas las solicitudes, algunas de las cuales son legítimas.
El profesor Bloom también dijo que su investigación sugirió que los científicos podrían continuar sus investigaciones independientemente de si se llaman más lesiones “oficiales”.
“Es importante examinar si es posible que otros sistemas científicos basados en la confianza también se hayan utilizado para ocultar datos relevantes para los orígenes / propagación temprana de # SARSCoV2. Esto incluye no solo buscar más en las bases de datos de secuencias, sino también en revisiones de artículos, informes de subvenciones, etc. ”, escribe.
“También hay implicaciones más amplias. Primero, el hecho de que este conjunto de datos haya sido eliminado debería hacernos escépticos de que se hayan compartido todas las demás secuencias tempranas de Wuhan relevantes. Ya sabemos que muchos laboratorios en China ordenaron destruir las primeras muestras:
“La tercera implicación importante es que los científicos deben mantenerse enfocados en el estudio basado en datos de los orígenes / propagación temprana de # SARSCoV2. Después de pasar los últimos 4 meses estudiando esto de cerca, soy cautelosamente optimista de que aún es probable que salgan a la luz datos relevantes adicionales.
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