La pandemia ha extendido los recursos del grupo, pero la Colaboración Interagencial de Análisis de Seguridad Alimentaria (IFSAC) ha desarrollado un plan provisional y continúa con su trabajo.
La organización se lanzó en 2011 cuando tres agencias de EE. UU., los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades, la Administración de Alimentos y Medicamentos y el Servicio de Inspección y Seguridad Alimentaria (FSIS) del USDA, la crearon para mejorar ciertos esfuerzos relacionados con la seguridad alimentaria.
Específicamente, su propósito es mejorar la coordinación de los esfuerzos analíticos federales de inocuidad de los alimentos y abordar las prioridades transversales para la recopilación, el análisis y el uso de datos de inocuidad de los alimentos.
“Desde sus inicios, el enfoque de IFSAC ha sido la atribución de la fuente de las enfermedades transmitidas por los alimentos: identificar qué alimentos son las fuentes más importantes de las principales enfermedades transmitidas por los alimentos seleccionadas. Como parte de este esfuerzo, IFSAC ahora produce estimaciones anuales para cuatro patógenos prioritarios: Salmonella, Escherichia coli O157, Listeria monocytogenes y Campylobacter”, según el Plan Estratégico Provisional 2022-2023 del grupo.
Las agencias federales y los expertos en seguridad alimentaria utilizan los análisis de IFSAC para ayudar a formar la planificación estratégica y las decisiones basadas en el riesgo; estimar los beneficios de las intervenciones; y evaluar el impacto de las intervenciones, como regulaciones, políticas y estándares de desempeño nuevos o revisados. Al reunir datos de una variedad de fuentes, explorar ampliamente una variedad de métodos y disciplinas y desarrollar métodos analíticos sólidos, los científicos de IFSAC pueden mejorar las estimaciones de las fuentes de enfermedades transmitidas por los alimentos.
Las actividades de IFSAC se han visto sustancialmente afectadas por la pandemia mundial de COVID-19, según un comunicado que acompaña al plan provisional 2022-23 del grupo. Durante 2020 y 2021, muchos miembros del personal de CDC, FDA y FSIS que lideran y participan en proyectos de IFSAC y su supervisión fueron enviados a los esfuerzos de respuesta de COVID-19, tuvieron que concentrarse en actividades relacionadas con la pandemia o cubrieron las actividades del programa de la agencia, mientras que otros se desplegó personal.
IFSAC continúa publicando estimaciones anuales de la atribución de fuentes de enfermedades transmitidas por alimentos, pero las limitaciones de recursos han retrasado algunos proyectos.
Como resultado de las limitaciones de recursos, los funcionarios de IFSAC desarrollaron un plan estratégico provisional, que describe los logros del grupo durante 2017-2021 e identifica actividades clave para 2022-2023. Cerca del final del período intermedio, el grupo tiene la intención de compartir información sobre su dirección, objetivos y enfoques para el trabajo futuro.
“Durante los años 2022–2023, continuaremos publicando informes anuales sobre la atribución de fuentes de enfermedades transmitidas por alimentos para patógenos prioritarios. Continuaremos mejorando los métodos para estimar la atribución de fuentes de enfermedades transmitidas por los alimentos utilizando datos de enfermedades esporádicas (no asociadas a brotes) y de brotes, buscando colaboraciones externas según sea necesario para maximizar las capacidades y el acceso a las fuentes de datos”, según el plan provisional del grupo.
Específicamente, los líderes de IFSAC tienen la intención de dar prioridad a las siguientes actividades:
• Analizar las tendencias en enfermedades asociadas a brotes de enfermedades transmitidas por los alimentos durante los últimos 20 años y enviar un manuscrito a una revista revisada por pares que describa sus métodos y resultados.
• Continuar desarrollando y refinando enfoques de aprendizaje automático para predecir las fuentes alimenticias de enfermedades humanas con fuentes desconocidas mediante el uso de secuenciación del genoma completo (WGS) para comparar aislados de Salmonella de fuentes conocidas con aquellos de personas enfermas cuya fuente se desconoce.
• Adaptar los métodos basados en WGS desarrollados para Salmonella para atribuir enfermedades esporádicas de Campylobacter a las fuentes de alimentos.
• Evaluar la frecuencia de brotes plurianuales y su impacto en los análisis de atribución de fuentes y decidir si se mejoran los métodos para usarlos en modelos de atribución de fuentes basados en brotes.
• Colaborar con el personal de FoodNet para estimar fracciones atribuibles a la población para fuentes alimentarias clave de enfermedades esporádicas de Salmonella Enteritidis y Campylobacter mediante el desarrollo de estudios de casos y controles utilizando datos de determinación de exposición de casos de FoodNet y datos de encuestas de población de FoodNet.
• Continuar desarrollando un método para incorporar en las estimaciones de atribución aquellos brotes asociados con alimentos complejos (es decir, alimentos con múltiples ingredientes) para los cuales se desconoce el ingrediente contaminado.
“El enfoque principal de IFSAC sigue siendo mejorar las estimaciones de las fuentes alimentarias de enfermedades causadas por los principales patógenos. Mientras que IFSAC siempre se ha centrado en estimar las fuentes de todas las enfermedades, no solo las asociadas a brotes, hasta ahora los métodos solo han utilizado datos de brotes. En los últimos años, desarrollamos métodos para usar datos de enfermedades esporádicas para hacer estas estimaciones”, según el plan provisional.
“En este período intermedio, continuaremos evaluando nuestro enfoque para atribuir enfermedades por Campylobacter a categorías específicas de alimentos. Nuestros informes recientes han resaltado los desafíos asociados con la atribución de enfermedades por Campylobacter a los alimentos en función de los datos de brotes, debido a la enorme influencia de los brotes de alimentos que no se consumen ampliamente pero que tienen un alto riesgo de enfermedad, como la leche sin pasteurizar y el hígado de pollo”.
El trabajo de IFSAC de 2017-2021 incluyó:
• Desarrollar un enfoque de modelado estadístico ponderado por actualidad para estimar las fuentes de enfermedades transmitidas por los alimentos causadas por patógenos específicos y publicar el método en una revista revisada por pares.
• Actualizar el esquema de IFSAC para clasificar los alimentos implicados en brotes de enfermedades transmitidas por los alimentos y describirlo en un artículo publicado revisado por pares.
• Producir estimaciones anuales de las fuentes de enfermedades transmitidas por los alimentos para Salmonella, Escherichia coli O157, Listeria monocytogenes y Campylobacter para 2015–2019.
• Analizar los datos de brotes de enfermedades por Salmonella adquiridas por el consumo de productos de carne de cerdo para respaldar el borrador de los estándares de desempeño del USDA para la contaminación mínima aceptable por Salmonella de los cortes de carne de cerdo y los productos de carne de cerdo molida.
• Continuar explorando nuevos métodos y modelos para la atribución de fuentes de enfermedades transmitidas por los alimentos, incluidos los bosques aleatorios y otros algoritmos de aprendizaje automático.
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